Gli eteri sono molecole simili nella struttura all'acqua e agli alcoli. L'angolo tra i legami C- O -C è maggiore che in acqua a causa delle repulsioni steriche tra gruppi voluminosi.

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Nel caso degli epossidi, la caratteristica più rilevante è la tensione anulare dovuta ad angoli di legame molto distanti da 109º, il legame C- O -C presenta un angolo di 61º.
Gli eteri sono molecole molto polari. Pertanto, l'etere dietilico presenta un momento di dipolo di 1,2 D. Questo momento di dipolo è ancora più importante negli eteri ciclici (ossaciclopropano, tetraidrofurano) che presentano momenti di dipolo superiori a 1,8 D, simili all'acqua.
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