Эфиры представляют собой молекулы, сходные по строению с водой и спиртами. Угол между связями С- О -С больше, чем в воде из-за стерического отталкивания между объемными группами.
В случае эпоксидов наиболее значимой характеристикой является натяжение кольца из-за углов связи, очень далеких от 109º, связь C- O -C представляет собой угол 61º.
Эфиры — очень полярные молекулы. Таким образом, диэтиловый эфир имеет дипольный момент 1,2 Д. Этот дипольный момент еще более важен для циклических эфиров (оксациклопропан, тетрагидрофуран), которые имеют дипольный момент выше 1,8 Д, подобно воде.
