L'indolo presenta un idrogeno acido sull'atomo di azoto, con pKa= 17. Usando basi forti può essere deprotonato, formando l'anione indolio.

Reazione dell'indolio con diversi elettrofili:

a) Alchilazione dell'indolo:

b) Apertura di epossidi:

c) Attacco ad a,b -insaturi:

Le basi che rilasciano nel mezzo i cationi di litio o magnesio (organolitico e magnesio) bloccano la coppia libera di azoto, producendo l'attacco attraverso l'anello.

Come si può vedere nell'esempio precedente, l'indolo con la coppia di azoto bloccata attacca attraverso la sua posizione 3, è una sostituzione elettrofila.

Gli indoli 1-sostituiti hanno idrogeni acidi in posizione 2, che possiamo rimuovere usando basi forti (organolitici).

Una fase di idrolisi acida protona il carbossilato.