Os seguintes critérios se aplicam até que alguém decida inequivocamente:
1. Um composto contendo nitrogênio.
2. O componente que contém o heteroátomo de maior prioridade (sem nitrogênio).
3. O componente que contém o maior dos anéis.
4. O componente que contém o maior número de heteroátomos de qualquer tipo.
5. O componente que contém a maior variedade de heteroátomos.
6. O componente que contém o maior número de heteroátomos mais preferidos.
7. O componente que, antes da condensação, possui localizadores menores para seus heteroátomos.
8. Regra 7, considerando os heteroátomos em ordem de prioridade.

Nos seguintes heterociclos fundidos, o componente base é representado em azul.

Na molécula [1] o componente base é escolhido pela "regra 1", ciclo contendo nitrogênio.

Na molécula [2], a regra 1 não se aplica, pois nenhum dos ciclos possui nitrogênio, então vamos para a regra 2. Como o oxigênio tem prioridade sobre o enxofre, escolhemos o furano como componente base.

Na molécula [3] as duas primeiras regras falham, mas a terceira decide já que os anéis são de tamanhos diferentes, escolhendo o ciclo de seis membros como base.

Na molécula [4] precisamos atingir a regra 4 para obter o heterociclo base, sendo este o que possui o maior número de heteroátomos.