Projetar consiste em desenhar uma molécula em duas dimensões (plano). Na projeção de Fischer, a molécula é desenhada em forma de cruz com os substituintes que vão para o fundo do plano na vertical e os grupos que saem em nossa direção na horizontal, o ponto de interseção de ambas as linhas representa o carbono projetado.
Embora seja costume deixar a cadeia carbônica na vertical, a molécula pode ser rotacionada de maneiras diferentes, dando origem a projeções de Fischer que parecem diferentes, mas na verdade representam a mesma molécula.
Para verificar se a projeção está correta, vamos atribuir a notação R/S à molécula e sua projeção.
Observe que com o hidrogênio na horizontal, o spin dá a notação alterada.
Agora faremos a projeção de uma molécula com dois centros quirais
Para projetar uma molécula em Fischer é necessário desenhá-la na conformação eclipsada. Os substituintes que permanecem no plano são colocados acima e abaixo da projeção. Os grupos que saem em nossa direção (cunhas) estão dispostos à direita na projeção, e os que vão para baixo (linhas tracejadas) estão dispostos à esquerda. 
