Se aplican los siguientes criterios hasta que uno decida inequívocamente:
1. Un compuesto que contenga nitrógeno.
2. El componente que contenga el heteroátomo de mayor prioridad (sin nitrógeno).
3. El componente que contenga el mayor de los anillos.
4. El componente que contenga el mayor número de heteroátomos de cualquier tipo.
5. El componente que contenga la mayor variedad de heteroátomos.
6. El componente que contenga el mayor número de heteroátomos de mayor preferencia.
7. El componente que antes de la condensación, posea para sus heteroátomos los localizadores menores.
8. Regla 7, considerados los heteroátomos por orden de prioridad.

En los siguientes heterociclos condensados el componente base se representa en color azul.

nomenclatura heterociclos condensados compoente base

En la molécula [1 ] el componente base se elige por la "regla 1", ciclo que contiene nitrógeno.

En la molécula [2 ] no es aplicable la regla 1, ya que ninguno de los ciclos posee nitrógeno, así que pasamos a la regla 2.  Dado que el oxígeno tiene prioridad sobre el azufre, elegimos como componente base el furano.

En la molécula [3 ] fallan las dos primeras reglas, pero la tercera decide dado que los anillos son de diferente tamaño, eligiendo como base el ciclo de seis miembros.

En la molécula [4 ] necesitamos llegar a la regla 4 para obtener el heterociclo base, siendo este el que posee el mayor número de heteroátomos.