La fragmentation de Wharton est une réaction concertée dans laquelle un groupe partant est situé en position 4 par rapport à un groupe donneur d'électrons. Le transfert des paires libres du groupe donneur produit la fragmentation de la liaison voisine et la perte du groupe partant avec formation de doubles liaisons. Voyons un exemple :
La réaction présente une stéréochimie définie impliquant l'arrangement anti des liaisons de rupture (dessiné en rouge).
Les 1,3-diols sont des substrats fréquents dans cette réaction. Ils nécessitent une transformation préalable en monomésylates ou monotosylates pour une fragmentation ultérieure en milieu basique.
