Isomerisme Cis-trans atau geometris disebabkan oleh rotasi terbatas di sekitar ikatan karbon-karbon. Pembatasan ini mungkin karena adanya ikatan rangkap atau siklus. Jadi, 2-butena dapat berada dalam bentuk dua isomer, yang disebut cis dan trans. Isomer dengan hidrogen pada sisi yang sama disebut cis, dan isomer dengan sisi yang berlawanan disebut trans.
[1] cis -2-butena
[2] trans -2-butena
Senyawa siklik, karena kekakuannya, juga menunjukkan isomerisme geometris. Jadi, 1,2-dimetilsikloheksana dapat ada sebagai dua isomer. Satu dengan hidrogen di sisi yang sama disebut isomer cis dan satu dengan hidrogen di sisi yang berlawanan disebut trans. 
[3] cis -1,2-dimetilsikloheksana
[4] trans -1,2-dimetilsikloheksana
[5] trans -2-heksena
[6] cis -2-heksena
Perhatikan bahwa notasi cis/trans ditulis dengan huruf miring kecil. Dalam tulisan tangan, huruf miring diganti dengan garis bawah.
