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Problema con secuencia 11 años 9 meses antes #2936

Hola, estudiando esta tarde me he encontrado con un problema en esta secuenciacion de un peptido problema, que no se que hacer.

\"Se ha aislado un octapectido a partir de un hongo raro, que perviene la caida del pelo.
El analisis de aa nos da una composicion de:
Lys2,Asp1,Tyr1,Phe1,Gly1,Ser1,Ala1
El peptido se hace reaccionar con DNFB, y tras la hidrolisis acida del mismo se obtiene DNF-Alanina. La digestion con tripsina da peptidos con la composicion:
Lys1,Ala1,Ser1,Gly1,Phe1,Lys1 , junto a un dipeptido.
La reaccion con quimiostripsina libera acido aspartido, un tetrapeptido que libera DNF-Glycina tras reaccion con DNFB seguido de hidrolisis.

¿Cual es la secuencia del peptido problema??\"

Yo creo que tenemos la Alalina terminar , por lo del reactivo de Sanger, que se nos une al grupo amino terminal, pero ya el resto de la secuencia no lo se.

Haber si conseguis ayudarme.
Saludos

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Re: Problema con secuencia 11 años 9 meses antes #2943

Buenas, despues de un rato pensando, intentandolo creo que lo he conseguido sacar:

El analisis de aa, nos dice los que vamos a tener, y su cantidad:

Lys2,Asp1,Tyr1,Phe1,Gly1,Ser1,Ala1

a) COmo con el reactivo de Sanger se nos forma la DNF-Alanina, ya sabemos que tenemos a Alanina con el extremo N libre.

Ala- xxxx resto de aa.

b) Luego nos dice que la digestion con Tripsina( Hidroliza a la derecha de Arg y Lys) nos dice que se nor forma un peptido con la sgueinte composicion: lys1,Ala1,Ser1,Gly1,Ph1,Lys1 y un dipeptido.

Viendo la composicion del peptido inicial, y viendo el que se nor forma aqui, llego a la conclusion que el dipeptido tiene de composicion Asp y Try, y tiene que tener antes una Lys, que es por donde la enzima romperia, quedndo:

|| Lys-(Arg + Try[No sabemos el orden solo que estan al final])

c) Con Quimiotripsina ( Rompe derencha de Phe,Trt,Trp), se libera Ac. Aspartido, un tetrapeptido de composicion : Lys1,Ser1,Phe1,Ala1, y un tripeptido que libera DNF-GLycina tras reaccionar cn DNFB y posterior hidrolisis.

En la composicion de aa, vemos que tenemos un Phe y un Try, vamos a tener 2 lugares por donde la quimiotripsina va a romper, y se nos formaran 3 restos.

El Asp, como vimos en con la tripsina, va a estan en las 2 ultimas posiciones posibles, ahora completamos y vemos que estara con el extremo C libre, con lo que ya sabemos que despues de la Lys, ira Try y luego Asp.( luego pongo la cadena completa)

Ahora nos queda por colocar el Phe, que va a separar el tripeptido del tetrapaptido, como nos dice que la Gly da la reaccion de Sanger, debe tener el N libre, con lo que va a estar limitando con el Phe, que sera por donde cortemos, quedando:

Tetrapeptido con Phe - Tripeptido con Try - Asp

Ala-(Lys + Ser [Sin saber orden]-Phe-Lys-Try-Aps

Ya lo unico que me queda saber, es donde va la Lys, y la Ser, despues de la Ala, si en posicion 2 o en 3, que eso no lo he consegudio descifrar :woohoo:

Saludos

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