Adanya gugus asam (-COOH) dan basa (-NH 2 ) memberikan sifat asam-basa yang khas pada asam amino.
Dalam media asam kuat, gugus amino dan gugus asam terprotonasi dan asam amino memiliki bentuk sebagai berikut:
Saat pH naik, gugus yang lebih asam, H dengan pKa yang lebih rendah, terdeprotonasi, membentuk spesi netral yang disebut Zwitterion.
Ketika asam amino berada dalam media dasar, ia kehilangan proton dari gugus amino, sehingga menimbulkan spesies yang terdeprotonasi.
PH di mana konsentrasi Zwitterion maksimum (asam amino tidak memiliki muatan bersih) disebut pH isoelektrik atau titik isoelektrik.
Definisi lain dari titik isoelektrik adalah: pH di mana konsentrasi spesies terprotonasi dan terdeprotonasi menyamakan kedudukan.
pH isoelektrik dihitung sebagai rata-rata pK a,1 dan pK a,2 , yaitu rata-rata pKas dari tahapan yang membentuk dan menguraikan Zwitterion.