Las reglas para dar configuración absoluta a un centro estereogénico son las siguientes:
1. Dar prioridad a los grupos que parten del centro estereogénico por número atómico
2. En el caso de isótopos la prioridad se da por masa atómica.
3. Si el giro, siguiendo los tres grupos de más prioridad con el cuarto al fondo, es en el sentido de las agujas del reloj, el centro estereogénico es R.
4. Si el giro es en sentido contario a las agujas del reloj, el centro estereogénico es S.
Las sales de amonio con cuatro sustituyentes diferentes son compuestos quirales, la notación al nitrógeno quiral se da igual que a un carbono.
Las aminas también pueden ser quirales si sus tres sustituyentes son diferentes, siendo el par libre el grupo de prioridad d. Sin embargo, las aminas quirales racemizan debido a la inversión del nitrógeno y no pueden aislarse los enantiómeros puros.
En los iones oxonio el oxígeno se comporta como un centro esterogénico, dando lugar a moléculas quirales.
