Три атома углерода циклопропана лежат в одной плоскости, в отличие от других циклоалканов, которые не являются плоскими. Циклопропан характеризуется большой угловой деформацией из-за валентных углов значительно ниже 109,5°. Огромное напряжение, которому подвергается цикл, заставляет углерод-углеродные связи изгибаться наружу, создавая очень характерные связи, называемые «банановыми» связями.

Циклопропан имеет три атома водорода, обращенные друг к другу (затмеваемые атомы водорода), которые еще больше увеличивают напряжение молекулы. По этой причине это самый неустойчивый циклоалкан.