Dos aminoácidos se unen bajo condiciones adecuadas para formar un dipétido.  Si hacemos reaccionar la glicina (gly) con la alanina (ala) se obtiene una mezcla de 4 productos: gly-ala, ala-gly, gly-gly y ala-ala.

Para obtener de forma exclusiva el dipéptido gly-ala, es necesario proteger el grupo amino de la glicina y el grupo ácido de la alanina. De esta manera la reacción tendrá lugar de forma exclusiva entre el grupo ácido de la glicina y el amino de la alanina.

La protección de los grupos amino y ácido permite obtener de forma selectiva el dipéptido gly-ala.